體視顯微鏡因其所具備的眾多優點在工農業和科研各部門有著廣泛的應用。若在使用過程中出現一些問題可根據實際情況自行解決。根據實際使用情況常見的故障有:視場較模糊或有臟物，可能的原因有標本上有臟物，目鏡表面有臟物，物鏡表面有臟物，工作板表面有臟物。

體視顯微鏡在使用前的調校主要有: 調焦，瞳距調節兩個步驟。下面分別進行說明。

1、調焦:將工作臺板放入底座上的臺板安裝孔內。觀察透明標本時，選用毛玻璃合板;觀察不透明標本時，選用黑白臺板。然后松開調焦滑座上的緊固螺釘，調節鏡體的高度，使其與所選用的物鏡放大倍數大體一致的工作距離。調好后，須鎖緊緊固打。調焦時，建議選用平面物體，如印有字符的平整織張、直尺、三角板等，視度調節:先將左右目鏡筒上的視度圈均調至0刻線位置。通常情況下，先從右目鏡筒中觀察。

將變倍手輪轉至低倍位置，轉動調焦手輪和視度調節圈對標本進行調節，直至標本的圖像清晰后，再把變倍手輪裝至高倍位置繼續進行調節直到標本的圖像清晰為止，此時，用左目鏡筒觀察，如不清晰則沿軸向調節左目鏡筒上的視度圈，直到標本的圖像清晰為止。

2、瞳距調節: 扳動兩目鏡筒，可以改變兩目鏡筒的出瞳距離。

當使用者觀察視場中的兩個圓形現場完全重合時，說明距已調節好。應該注意的是由于個體的視力及眼睛的調節差異，因此，不同的使用者或即便是同一使用者在不同時間使用同一臺體視顯微鏡時，應分別進行齊集調整，以便獲得很好的觀察效果，無論是更換上光源燈泡，還是更換下光源燈泡，在更換前，請務必將電源開關關上，電源線插頭一定要從電源插座上拔下。